Stichting Het Rhedens wordt bestuurd volgens het Raad van Toezichtmodel, met een Bestuur en een Raad van Toezicht. Het bestuur bestaat uit één persoon: de bestuurder. De Raad van Toezicht uit vijf personen. Het bestuur en de Raad van Toezicht richten zich bij de vervulling van hun taak naar het belang en de opdracht van de stichting en de met haar verbonden organisatie. De bestuurder stuurt vanuit een gezamenlijk gevormde visie op de organisatie en het onderwijs en op het realiseren van deze visie. De hoofdtaak van de onderwijsorganisatie is het uitvoeren en ontwikkelen van goed onderwijs voor leerlingen en daarmee geeft de bestuurder leiding aan het uitvoeren en ontwikkelen van de kwaliteit van het onderwijs. De Raad van Toezicht houdt toezicht op het beleid en de algemene gang van zaken, het functioneren van de bestuurder en staat de bestuurder met raad terzijde. Ook bewaakt de Raad van Toezicht de verankerde grondslag en de doelstelling van de stichting.